La caractérisation des sols du complexe humide d'El-Kala a été réalisée sur la base d'une typologie géomorphologique qui a mis en évidence six zones humides différentes (les dépressions inter dunaires, zone de contact flysch de Numidie / dunes, zone de contact plaine alluviale /les dunes et les dépressions lacustres). Il ressort que l'évolution des sols est contrôlée par la topographie, la roche mère, le taux d'humidité et sa fluctuationet par la nature et densité du couvert végétal. Les eaux sont acide, non salée, pauvre en éléments minéraux et changent peu en fonction des saisons. Le couvert végétal est dense très diversifiées dont 1/3 des espèces évoluent dans une ambiance climatique du type tropicale et sub-tropicale. Cette végétation produit une quantité de matière organique assez appréciable; dont les taux augmentent de l'amont vers l'aval des dépressions et diminuent de la surface vers la profondeur avec une accumulation moins importante en surface des sols tourbeux. L'analyse pollinique de cinq séquences tourbeuses a mis en évidence deux périodes représentées par deux assemblages polliniques différents, les dépôts holocènes (actuels) et les dépôts du Tardiglaciaire.
